الصوفية يدعون أن الإمام أحمد بن عيسى المهاجر المقبور في حضرموت بأنه كان سنياً وأنه تعلم عن أجداده منهم جعفر الصادق كانوا على طريقة أهل السنة وكذلك الإمامية تدعي
الصوفية يدعون أن الإمام أحمد بن عيسى المهاجر المقبور في حضرموت بأنه كان سنياً وأنه تعلم عن أجداده منهم جعفر الصادق كانوا على طريقة أهل السنة وكذلك الإمامية تدعي أنه كان إمامياً وهل بايع الإمام الهادي عليه السلام؟
الذي يظهر أن مذهبه هو مذهب أهل البيت حسبما وضحه العلامة محمد بن عقيل وغيره
وخرج إلى اليمن لغرض نصرة الإمام الهادي ولما دخل اليمن وجد أن الإمام الهادي قد مات.